Doktrinavdelningen ansvarar för den strategiska och operativa planeringens forskningsmässiga kunskapsbas. Syftet med den forskning som bedrivs på avdelningen är att utveckla försvarsmaktens verksamhet på lång sikt. De omfattande forskningsuppgifterna genomförs under ledning av Huvudstabens planeringsavdelning i samarbete med flera parter, såsom Huvudstabens avdelningar, Försvarshögskolan och andra anstalter inom försvarsmakten.

Informationstekniska avdelningen forskar i radiosensorteknik och påverkningssystem, krigföring i datanätverk och ledningssystem. Avdelningen erbjuder även tjänster inom kalkylvetenskap och modellering.

Vapenteknologiska avdelningen ansvarar för forskning inom vapensystem och smygteknik. Avdelningen forskar till exempel i ballistiska skydd, sensorer för vapensystem och militära laserapplikationer.

Avdelningen för sprängmedel och CBRN forskar i material, redskap och system relaterade till sprängämnen och skydd. Gällande sprängämnen fokuserar man särskilt på upprätthållande av säkerhet och prestanda under sprängämnenas hela livscykel. Avdelningens centrallaboratorium stöder även försvarsmaktens övriga enheter.

Avdelningen för handlingsförmåga forskar i och utvecklar handlingsförmågan och lämpligheten hos försvarsmaktens personal. Den drar nytta av psykologisk kompetens och forskar bland annat i soldaters prestationsförmåga i exceptionellt utmanande förhållanden. Avdelningen ansvarar även för de psykologiska lämplighetstester som försvarsmakten behöver.