Rannikkolaivaston komentajana aloittaa 1. heinäkuuta 2016 kommodori Erkki Mikkola.
Rannikkolaivaston nykyinen komentaja, kommodori Timo Hirvonen siirtyy 1. toukokuuta alkaen esikuntapäälliköksi Merivoimien esikuntaan. Touko- ja kesäkuun ajan Rannikkolaivaston komentajana toimii laivaston nykyinen esikuntapäällikkö, komentaja Tuomas Tiilikainen.